Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3BNH8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BNH8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BNH8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms