Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL3A8MV65 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms