Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms