Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP69A5D8W1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms