Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR11A4FU01 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms