Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX13Q9Y5W8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX13Q9Y5W8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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