Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms