Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms