Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP11Q9Y3A2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP11Q9Y3A2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms