Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POLR1DQ9Y2S0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms