Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIF3AQ9Y2N7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms