Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms