Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAPPC2LQ9UL33 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms