Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms