Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRP2BPQ9P2M1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms