Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRBP1Q9P2E9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms