Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRFN1Q9P244 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms