Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms