Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1BQ9NZR2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1BQ9NZR2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms