Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms