Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms