Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms