Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSHZ2Q9NRE2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms