Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms