Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A20Q9NP91 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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