Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms