Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms