Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CNTNAP3Q9BZ76 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CNTNAP3Q9BZ76 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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