Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms