Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms