Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106CQ9BVX2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms