Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms