Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3RQ99062 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms