Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms