Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms