Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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