Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms