Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZDHHC12Q96GR4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZDHHC12Q96GR4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms