Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TOPBP1Q92547 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms