Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD1Q8NHV4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms