Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms