Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms