Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms