Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms