Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECW1Q76N89 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms