Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD1Q6UXZ0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms