Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms