Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRC8EQ6NSJ5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms