Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TBC1D3CQ6IPX1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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