Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms